연강수량은 1,530㎜로 울릉도 다음으로 비가 많이 오는 지역이며, 남제주지방은 이보다 더 많은 비가 내린다. 북서계절풍과 관련된 지형성 강수로 한라산 북쪽 사면은 겨울철에 눈이 많이 내리며, 한라산 기슭에는 초겨울에 내린 눈이 이듬해 봄까지 녹지 않는다. 반면 한라산 남쪽 사면에 있는 서귀포를 중심으로 한 해안지방은 따뜻하여 눈이 내린다 해도 쌓이지 않고 곧 녹아버린다. 또한 제주에는 바람이 많아 연평균 풍속 4.8m/sec로, 특히 겨울철 바람이 차고 매섭다.

북제주지방의 연평균기온이 14.7℃, 1월 평균기온 4.8℃, 8월 평균기온 25.8℃인 데 반해, 남제주지방은 연평균기온 16℃, 1월 평균기온 6℃, 8월 평균기온 26.6℃를 나타낸다. 특히 서귀포시는 한라산이 한랭한 북서계절풍을 막아주기 때문에 겨울 날씨가 제주도에서도 가장 따뜻하다. 연평균강수량은 1,440㎜(제주시), 1,688㎜(서귀포시)로 한국 최다우지역에 해당한다. 중산간지역은 지형성 강우의 영향으로 더 많은 강수량을 나타내며, 특히 7∼9월에는 열대성 저기압(태풍)의 영향으로 많은 비가 내린다.

기후가 고도에 따라 차이가 나기 때문에 난대림대·온대림대·한대림대 등 삼림대가 발달하였다. 식물 분포상태는 남북 간에 다소 차이가 있으나 대체로 북사면을 기준으로, 해발고도 70m 이하의 낮은 지대에는 아열대식물이 많으며, 녹나무를 주로 하는 상록활엽수림대가 발달했다. 700∼1,200m에는 서나무·개서나무·졸참나무 등 온대활엽수가 무성하며, 1,200∼1,500m에는 소나무·향나무·구상나무 등 한대침엽수림, 1,500∼1,700m에는 관목림, 1,850m 이상의 산정에는 고산식물대가 각각 전개된다. 남사면은 기후가 더 따뜻하므로 북사면보다 높이가 좀더 연장된다.